La collection de minéraux de l'université est composée d’environ 16 500 spécimens qui se répartissent entre une exposition permanente, réunissant environ 1500 spécimens, et des collections en réserve. Sur les 5 900 (environ) espèces minérales connues, la collection en possède environ 500. Si une partie de la collection est l’héritière de la collection de minéraux « historique » de l’Université de Paris, la collection actuelle est plutôt le fruit de dons et d’achats réalisés dans la seconde moitié du XXème siècle.
Elle entretient encore des liens étroits avec l’enseignement et la recherche scientifique, et de nombreux spécimens de la collection sont mobilisés chaque année par les chercheurs, et fait l’objet de nombreuses publications.