CDK13-related disorder: Report of a series of 18 previously unpublished individuals and description of an epigenetic signature - Sorbonne Université
Article Dans Une Revue Genetics in Medicine Année : 2022

CDK13-related disorder: Report of a series of 18 previously unpublished individuals and description of an epigenetic signature

Flavien Rouxel
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Raissa Relator
  • Fonction : Auteur
Jennifer Kerkhof
  • Fonction : Auteur
Haley Mcconkey
  • Fonction : Auteur
Michael Levy
  • Fonction : Auteur
Patricia Dias
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Mouna Barat-Houari
  • Fonction : Auteur
Nathalie Bednarek
Odile Boute
  • Fonction : Auteur
Nicolas Chatron
  • Fonction : Auteur
Florian Cherik
  • Fonction : Auteur
Andrée Delahaye-Duriez
  • Fonction : Auteur
Martine Doco-Fenzy
Laurence Faivre
  • Fonction : Auteur
Lucas Gauthier
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Michael Hildebrand
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Gaëtan Lesca
James Lespinasse
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Benoit Mazel
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Leonie Menke
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Angela Morgan
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Lucile Pinson
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Chloe Quelin
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Massimiliano Rossi
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Nathalie Ruiz-Pallares
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Frederic Tran-Mau-Them
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Imke van Kessel
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Marie Vincent
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Mathys Weber
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Marjolaine Willems
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Gwenael Leguyader
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Bekim Sadikovic
  • Fonction : Auteur
David Genevieve

Résumé

PurposeRare genetic variants in CDK13 are responsible for CDK13-related disorder (CDK13-RD), with main clinical features being developmental delay or intellectual disability, facial features, behavioral problems, congenital heart defect, and seizures. In this paper, we report 18 novel individuals with CDK13-RD and provide characterization of genome-wide DNA methylation.MethodsWe obtained clinical phenotype and neuropsychological data for 18 and 10 individuals, respectively, and compared this series with the literature. We also compared peripheral blood DNA methylation profiles in individuals with CDK13-RD, controls, and other neurodevelopmental disorders episignatures. Finally, we developed a support vector machine–based classifier distinguishing CDK13-RD and non–CDK13-RD samples.ResultsWe reported health and developmental parameters, clinical data, and neuropsychological profile of individuals with CDK13-RD. Genome-wide differential methylation analysis revealed a global hypomethylated profile in individuals with CDK13-RD in a highly sensitive and specific model that could aid in reclassifying variants of uncertain significance.ConclusionWe describe the novel features such as anxiety disorder, cryptorchidism, and disrupted sleep in CDK13-RD. We define a CDK13-RD DNA methylation episignature as a diagnostic tool and a defining functional feature of the evolving clinical presentation of this disorder. We also show overlap of the CDK13 DNA methylation profile in an individual with a functionally and clinically related CCNK-related disorder.
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hal-04587703 , version 1 (22-07-2024)

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Flavien Rouxel, Raissa Relator, Jennifer Kerkhof, Haley Mcconkey, Michael Levy, et al.. CDK13-related disorder: Report of a series of 18 previously unpublished individuals and description of an epigenetic signature. Genetics in Medicine, 2022, 24 (5), pp.1096-1107. ⟨10.1016/j.gim.2021.12.016⟩. ⟨hal-04587703⟩
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