Les outils de prédiction basés sur de l'apprentissage machine sont utilisés pour prédire des phénomènes complexes dans de nombreux secteurs de la société dont la recherche scientifique. Ces outils sont notamment utilisés pour contrecarrer la faiblesse de l'approche hypothético-déductive lorsque l'état de la connaissance n'est pas suffisant pour paramétriser correctement le phénomène sous la forme d'équations mathématiques. Ces outils soulèvent la problématique du prédire sans expliquer pour lequel il est important d'aborder la question philosophique du rapport entre la technique et la connaissance. Nous présentons dans cet article une esquisse de travaux philosophiques menés sous la direction de Franck Varenne. Il s'agit d'étudier les conditions d'utilisation de ces outils pour améliorer la connaissance scientifique dans un paradigme différent ou non de l'approche hypothético-déductive.