Comparative genomics of photosynthetic marine prokaryotes Prochlorococcus and Synechococcus
Génomique comparée des procaryotes synthétiques marins Prochlorococcus et Synechococcus
Résumé
The Picocyanobacteria of genres Prochlorococcus and Synechococcus are the most abundant photosynthetic organisms in the ocean. Their ecological success seems to be related to the implementation of different strategies to adapt to different ecological niches. However, the molecular basis to explain the adaptation of these cyanobacteria remain largely unknown. Recently, the genomes of three strains of Prochlorococcus (MED4, SS120 and MIT9313) and two strains of Synechococcus (WH8102 and WH7803) were sequenced. The comparison of these five genomes reveals a low level of genomic differentiation. Nevertheless, the presence of certain genes can be related to characteristics of their ecological niches. Similarly, our work has shown a process of reductive evolution in Prochlorococcus, a phenomenon which was hitherto known only in pathogenic or symbiotic bacteria.
Les picocyanobactéries des genres Prochlorococcus et Synechococcus sont les organismes photosynthétiques les plus abondants de l'océan. Leur succès écologique semble être lié à la mise en place de stratégies différentes leur permettant de s'adapter à des niches écologiques distinctes. Cependant, les bases moléculaires expliquant l'adaptation de ces cyanobactéries restent en grande partie inconnues. Récemment, les génomes de trois souches de Prochlorococcus (MED4, SS120 et MIT9313) et de deux souches de Synechococcus (WH8102 et WH7803) ont été séquencés. La comparaison de ces cinq génomes révèle un faible niveau de différenciation génomique. Néanmoins, la présence de certains gènes peut être reliée aux caractéristiques de leurs niches écologiques. De même, nos travaux ont montré un processus d'évolution réductive chez Prochlorococcus, un qui phénomène n'était jusqu'à présent connu que chez les bactéries pathogènes ou symbiotiques.