Phylogenetic affinities of two eukaryotic pathogens of marine macroalgae, Eurychasma dicksonii (Wright) Magnus and Chytridium polysiphoniae
Résumé
The 18 S rRNA genes of Eurychasma dicksonii and Chytridium polysiphoniae , pathogens of brown algae,were s equenced and u sed t o clarify their phylogenetic affiliations .E.d icksonii is consistently placed at the base of t he Peronosporomycota (Oomycota) with high bootstrap support.Nevertheless,its sequence is clearly separated from other terrestrial and freshwater Oomycota.The closest related marine group is a clade entirely composed of environmental s equences retrieved from marine s ediments and oceanic plankton samples.The genus Chytridium usually forms a clade that includes several other genera (alongside the clades of Monoblepharis -, Rhizophydium -, Lacustromyces -, Nowakowskiella -, Neocallimastix -and Spizellomyces -like organisms) w ithin t he Chytridiomycota, one of the principal lineages of the Eumycota.Interestingly,our sequence of C.p olysiphoniae differs drastically from other sequences of the genus Chytridium , forming a novel clade of t he Chytridiomycota, which also includes environmental sequences from water and soil samples.Consistent with these phylogenetic affiliations, C.p olysiphoniae has a chitin cell wall,whilst E.d icksonii has cellulose. Together,these results suggest that Eurychasma and Chytridium may become interesting model organisms as the currently only culturable and morphologically known representatives of a poorly understood aquatic biodiversity,pointing out the necessity to include marine representatives for phylogenetic studies of the Oomycota and Chytridiomycota.
Les gènes codant pour l’ARN ribosomique 18S de deux agents pathogènes d’algues brunes, Eurychasma dicksonii et Chytridium polysiphoniae, ont été séquencés afin de clarifier leur position phylogénétique. La séquence d’E. dicksonii se situe toujours à la base des Peronosporomycètes (Oomycètes) avec des valeurs de bootstrap élevées. Cependant elle est clairement séparée de celles des autres Oomycètes terrestres ou d’eau douce. Le groupe le plus proche est un clade contenant uniquement des séquences environnementales provenant de sédiments marins et de plancton océanique. Les espèces du genre Chytridium, groupées avec plusieurs autres genres (entre autres, Obelidium et Phlyctorhiza), forment un clade qui est voisin des organismes rattachés aux genres Mono-blepharis, Rhizophydium, Lacustromyces, Nowakowskiella, Neocallimastix et Spizellomyces, à l’intérieur des Chytridiomycètes, une des lignées principales des Eumycètes. La séquence de Chytridium polysiphoniae au contraire, forme avec des séquences environnementales aquatiques ou terrestres, un nouveau clade parmi les Chytridiomycètes, indiquant que la position systématique de cette espèce devra être revue. C. polysiphoniae contient de la chitine dans ses parois tandis que E. dicksonii contient de la cellulose, une composition pariétale en accord avec leurs positions phylogénétiques respectives. Ces résultats suggèrent qu’Eurychasma et Chytridium pourraient devenir des organismes modèles intéressants, étant les seuls représentants cultivables et morphologiquement connus d’une biodiversité aquatique très mal connue ; ceci met en évidence la nécessité d’inclure des représentants marins dans les études phylogénétiques des Oomycètes et des Chytridiomycètes.
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