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Filling the gap: Micro-C accesses the nucleosomal fiber at 100-1000 bp resolution.
Julien Mozziconacci
,
Romain Koszul
Article dans une revue
pasteur-01420328v1
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3D genome reconstruction from chromosomal contacts
Annick Lesne
,
Julien Riposo
,
Paul Roger
,
Axel Cournac
,
Julien Mozziconacci
Article dans une revue
hal-02324120v1
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Multiscale Structuring of the E. coli Chromosome by Nucleoid-Associated and Condensin Proteins
Virginia S. Lioy
,
Axel Cournac
,
Martial Marbouty
,
Stéphane Duigou
,
Julien Mozziconacci
,
et al.
Article dans une revue
hal-02180787v1
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Computer vision for pattern detection in chromosome contact maps
Cyril Matthey-Doret
,
Lyam Baudry
,
Axel Breuer
,
Rémi Montagne
,
Nadège Guiglielmoni
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-03263561v1
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Characterizing meiotic chromosomes' structure and pairing using a designer sequence optimized for Hi‐C
Héloise Muller
,
Vittore F Scolari
,
Nicolas Agier
,
Aurele Piazza
,
Agnès Thierry
,
et al.
Article dans une revue
hal-01890095v1
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Plasmodium falciparum population dynamics in a cohort of pregnant women in Senegal
Juliette Guitard
,
Pernille Andersen
,
Caroline Ermont
,
Sédami Gnidehou
,
Nadine Fievet
,
et al.
Article dans une revue
hal-03962282v1
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High-quality genome (re)assembly using chromosomal contact data
Hervé Marie-Nelly
,
Martial Marbouty
,
Axel Cournac
,
Jean-François Flot
,
Gianni Liti
,
et al.
Article dans une revue
hal-01138788v1
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Nucleosome positioning on large tandem DNA repeats of the ’601’ sequence engineered in Saccharomyces cerevisiae
Astrid Lancrey
,
Alexandra Joubert
,
Evelyne Duvernois-Berthet
,
Etienne Routhier
,
Saurabh Raj
,
et al.
Article dans une revue
hal-03343705v2
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Generation and Analysis of Chromosomal Contact Maps of Yeast Species.
Axel Cournac
,
Martial Marbouty
,
Julien Mozziconacci
,
Romain Koszul
Article dans une revue
pasteur-01419912v1
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3D organization of synthetic and scrambled chromosomes
Guillaume Mercy
,
Julien Mozziconacci
,
Vittore F Scolari
,
Kun Yang
,
Guanghou Zhao
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-01523221v1
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Kinetic Signature of Cooperativity in the Irreversible Collapse of a Polymer
Vittore F Scolari
,
Guillaume Mercy
,
Romain Koszul
,
Annick Lesne
,
Julien Mozziconacci
Article dans une revue
hal-01992814v1
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Chromosome folding and prophage activation reveal specific genomic architecture for intestinal bacteria
Quentin Lamy-Besnier
,
Amaury Bignaud
,
Julian R Garneau
,
Marie Titecat
,
Devon E Conti
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-04158849v1
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Condensin- and Replication-Mediated Bacterial Chromosome Folding and Origin Condensation Revealed by Hi-C and Super-resolution Imaging.
Martial Marbouty
,
Antoine Le gall
,
Diego I Cattoni
,
Axel Cournac
,
Alan Koh
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-01419993v1
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Transcription-induced domains form the elementary constraining building blocks of bacterial chromosomes
Amaury Bignaud
,
Charlotte Cockram
,
Céline Borde
,
Justine Groseille
,
Eric Allemand
,
et al.
Article dans une revue
hal-04468362v1
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Generation of a Metagenomics Proximity Ligation 3C Library of a Mammalian Gut Microbiota
Théo Foutel-Rodier
,
Agnès Thierry
,
Romain Koszul
,
Martial Marbouty
High-Density Sequencing Applications in Microbial Molecular Genetics, 612, pp.183-195, 2018, Methods in Enzymology, 978-0-12-815993-4. ⟨10.1016/bs.mie.2018.08.001⟩
Chapitre d'ouvrage
pasteur-02866616v1
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Exogenous chromosomes reveal how sequence composition drives chromatin assembly, activity, folding and compartmentalization
Christophe Chapard
,
Léa Meneu
,
Jacques Serizay
,
Alex Westbrook
,
Etienne Routhier
,
et al.
2023
Pré-publication, Document de travail
hal-04278801v1
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The silencing factor Sir3 is a molecular bridge that sticks together distant loci
Myriam Ruault
,
Vittore F Scolari
,
Luciana Lazar-Stefanita
,
Antoine Hocher
,
Isabelle Loïodice
,
et al.
2020
Pré-publication, Document de travail
hal-03013702v1
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L'organisation 3D des chromosomes synthétiques de levure
Guillaume Mercy
Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]. Sorbonne Université, 2018. Français. ⟨NNT : 2018SORUS034⟩
Thèse
tel-02111002v1
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Normalization of Chromosome Contact Maps: Matrix Balancing and Visualization
Cyril Matthey-Doret
,
Lyam Baudry
,
Shogofa Mortaza
,
Pierrick Moreau
,
Romain Koszul
,
et al.
Silvio Bicciato, Francesco Ferrari. Hi-C Data Analysis : methods and protocols, 2301, Springer US, pp.1-15, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-1390-0 (ebook). ⟨10.1007/978-1-0716-1390-0_1⟩
Chapitre d'ouvrage
pasteur-03376844v1
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Insight into Antigenic Diversity of VAR2CSA-DBL5ε Domain from Multiple Plasmodium falciparum Placental Isolates
Sédami Gnidehou
,
Leon Jessen
,
Stéphane Gangnard
,
Caroline Ermont
,
Choukri Triqui
,
et al.
Article dans une revue
hal-03962279v1
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Chromosomal scale assembly of parasitic wasp genome reveals symbiotic virus colonization
Jérémy Gauthier
,
Hélène Boulain
,
Joke J F A van Vugt
,
Lyam Baudry
,
Emma Persyn
,
et al.
Article dans une revue
hal-03127732v1
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Spatial reorganization of telomeres in long-lived quiescent cells
Micol Guidi
,
Myriam Ruault
,
Martial Marbouty
,
Isabelle Loïodice
,
Axel Cournac
,
et al.
Article dans une revue
hal-01206018v1
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A probabilistic approach for genome assembly from high-throughput chromosome conformation capture data
Hervé Marie-Nelly
Genomics [q-bio.GN]. Université Pierre & Marie Curie - Paris 6, 2013. English. ⟨NNT : ⟩
Thèse
tel-03822543v1
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Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant
Franck Picard
,
Myriam Ferro
,
Alice Cleynen
,
Marie Doumic
,
Xavier Duchemin
,
et al.
Comité national de la recherche scientifique. 2020
Rapport
hal-04360199v1
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Diagnosis accuracy of muscule MRI for autoimmune myopathies: Multicentric prospective study (DARWIM)
Yves Allenbach
,
Guillaume Mercy
,
Jean-Francois Deux
,
Frantz Foissac
,
Yoland Shoindre
,
et al.
4th Global Conference On Myositis (GCOM 2022), Jun 2022, Prague, Czech Republic
Poster de conférence
hal-03832571v1
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Chromosome-level quality scaffolding of brown algal genomes using InstaGRAAL, a proximity ligation-based scaffolder
Lyam Baudry
,
Martial Marbouty
,
Hervé Marie-Nelly
,
Alexandre Cormier
,
Nadège Guiglielmoni
,
et al.
2021
Pré-publication, Document de travail
hal-02947625v1
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Insights into early animal evolution from the genome of the xenacoelomorph worm Xenoturbella bocki
Philipp Schiffer
,
Paschalis Natsidis
,
Daniel Leite
,
Helen Robertson
,
François Lapraz
,
et al.
Article dans une revue
hal-04791315v1
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Bacterial Membrane Vesicles as a Novel Strategy for Extrusion of Antimicrobial Bismuth Drug in Helicobacter pylori
Sumith Kumar
,
Christine Schmitt
,
Olivier Gorgette
,
Martial Marbouty
,
Magalie Duchateau
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-04093078v1
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Chromosomal assembly of the flat oyster ( Ostrea edulis L.) genome as a new genetic resource for aquaculture
Isabelle Boutet
,
Homère Alves Monteiro
,
Lyam Baudry
,
Takeshi Takeuchi
,
Eric Bonnivard
,
et al.
Article dans une revue
hal-03896508v1
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Total synthesis of a functional designer eukaryotic chromosome.
Narayana Annaluru
,
Héloïse Muller
,
Leslie A. Mitchell
,
Sivaprakash Ramalingam
,
Giovanni Stracquadanio
,
et al.
Article dans une revue
pasteur-01420002v1
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