Classical Human Leukocyte Antigen Alleles and C4 Haplotypes Are Not Significantly Associated With Depression
Kylie P Glanville
(1)
,
Jonathan R I Coleman
(1)
,
Ken B Hanscombe
,
Jack Euesden
(1)
,
Shing Wan Choi
,
Kirstin L Purves
,
Gerome Breen
,
Tracy M Air
,
Till F M Andlauer
,
Bernhard T Baune
,
Elisabeth B Binder
,
Douglas H R Blackwood
,
Dorret I Boomsma
,
Henriette N Buttenschøn
,
Lucía Colodro-Conde
,
Udo Dannlowski
,
Nese Direk
,
Erin C Dunn
,
Andreas J Forstner
,
Eco J C de Geus
,
Hans J Grabe
,
Steven P Hamilton
,
Ian Jones
,
Lisa A Jones
,
James A Knowles
,
Zoltán Kutalik
,
Douglas F Levinson
,
Glyn Lewis
,
Penelope A Lind
,
Susanne Lucae
,
Patrik K Magnusson
,
Peter Mcguffin
,
Andrew M Mcintosh
,
Yuri Milaneschi
,
Ole Mors
,
Sara Mostafavi
,
Bertram Müller-Myhsok
,
Nancy L Pedersen
,
Brenda W J H Penninx
,
James B Potash
,
Martin Preisig
,
Stephan Ripke
,
Jianxin Shi
,
Stanley I Shyn
,
Jordan W Smoller
,
Fabian Streit
,
Patrick F Sullivan
,
Henning Tiemeier
,
Rudolf Uher
,
Sandra van der Auwera
,
Myrna M Weissman
,
Paul F O'Reilly
,
Cathryn M Lewis
,
Naomi R Wray
,
Stephan Ripke
,
Manuel Mattheisen
,
Maciej Trzaskowski
,
Enda M Byrne
,
Abdel Abdellaoui
,
Mark J Adams
,
Esben Agerbo
,
Tracy M Air
,
Till F M Andlauer
,
Silviu-Alin Bacanu
,
Marie Bækvad-Hansen
,
Aartjan T F Beekman
,
Tim B Bigdeli
,
Elisabeth B Binder
,
Julien Bryois
,
Henriette N Buttenschøn
,
Jonas Bybjerg-Grauholm
,
Na Cai
,
Enrique Castelao
,
Jane Hvarregaard Christensen
,
Toni-Kim Clarke
,
Jonathan R I Coleman
,
Lucía Colodro-Conde
,
Baptiste Couvy-Duchesne
(2)
,
Nick Craddock
,
Gregory E Crawford
,
Gail Davies
,
Ian J Deary
,
Franziska Degenhardt
,
Eske M Derks
,
Nese Direk
,
Conor V Dolan
,
Erin C Dunn
,
Thalia C Eley
,
Valentina Escott-Price
,
Farnush Farhadi Hassan Kiadeh
,
Hilary K Finucane
,
Jerome C Foo
,
Andreas J Forstner
,
Josef Frank
,
Héléna A Gaspar
,
Michael Gill
,
Fernando S Goes
,
Scott D Gordon
,
Jakob Grove
,
Lynsey S Hall
,
Christine Søholm Hansen
,
Thomas F Hansen
,
Stefan Herms
,
Ian B Hickie
,
Per Hoffmann
,
Georg Homuth
,
Carsten Horn
,
Jouke-Jan Hottenga
,
David M Hougaard
,
David M Howard
,
Marcus Ising
,
Rick Jansen
,
Ian Jones
,
Lisa A Jones
,
Eric Jorgenson
,
James A Knowles
,
Isaac S Kohane
,
Julia Kraft
,
Warren W Kretzschmar
,
Zoltán Kutalik
,
Yihan Li
,
Penelope A Lind
,
Donald J Macintyre
,
Dean F Mackinnon
,
Robert M Maier
,
Wolfgang Maier
,
Jonathan Marchini
,
Hamdi Mbarek
,
Patrick Mcgrath
,
Peter Mcguffin
,
Sarah E Medland
,
Divya Mehta
,
Christel M Middeldorp
,
Evelin Mihailov
,
Yuri Milaneschi
,
Lili Milani
,
Francis M Mondimore
,
Grant W Montgomery
,
Sara Mostafavi
,
Niamh Mullins
,
Matthias Nauck
,
Bernard Ng
,
Michel G Nivard
,
Dale R Nyholt
,
Paul F O'Reilly
,
Hogni Oskarsson
,
Michael J Owen
,
Jodie N Painter
,
Carsten Bøcker Pedersen
,
Marianne Giørtz Pedersen
,
Roseann E Peterson
,
Erik Pettersson
,
Wouter J Peyrot
,
Giorgio Pistis
,
Danielle Posthuma
,
Jorge A Quiroz
,
Per Qvist
,
John P Rice
,
Brien P Riley
,
Margarita Rivera
,
Saira Saeed Mirza
,
Robert Schoevers
,
Eva C Schulte
,
Ling Shen
,
Jianxin Shi
,
Stanley I Shyn
,
Engilbert Sigurdsson
,
Grant C B Sinnamon
,
Johannes H Smit
,
Daniel J Smith
,
Hreinn Stefansson
,
Stacy Steinberg
,
Fabian Streit
,
Jana Strohmaier
,
Katherine E Tansey
,
Henning Teismann
,
Alexander Teumer
,
Wesley Thompson
,
Pippa A Thomson
,
Thorgeir E Thorgeirsson
,
Matthew Traylor
,
Jens Treutlein
,
Vassily Trubetskoy
,
Andrés G Uitterlinden
,
Daniel Umbricht
,
Sandra van der Auwera
,
Albert M van Hemert
,
Alexander Viktorin
,
Peter M Visscher
,
Yunpeng Wang
,
Bradley T Webb
,
Shantel Marie Weinsheimer
,
Jürgen Wellmann
,
Gonneke Willemsen
,
Stephanie H Witt
,
Yang Wu
,
Hualin S Xi
,
Jian Yang
,
Futao Zhang
,
Volker Arolt
,
Bernhard T Baune
,
Klaus Berger
,
Dorret I Boomsma
,
Sven Cichon
,
Udo Dannlowski
,
Ejc de Geus
,
J Raymond Depaulo
,
Enrico Domenici
,
Katharina Domschke
,
Tõnu Esko
,
Hans J Grabe
,
Steven P Hamilton
,
Caroline Hayward
,
Andrew C Heath
,
Kenneth S Kendler
,
Stefan Kloiber
,
Glyn Lewis
,
Qingqin S Li
,
Susanne Lucae
,
Pamela Af Madden
,
Patrik K Magnusson
,
Nicholas G Martin
,
Andrew M Mcintosh
,
Andres Metspalu
,
Ole Mors
,
Preben Bo Mortensen
,
Bertram Müller-Myhsok
,
Merete Nordentoft
,
Markus M Nöthen
,
Michael C O'Donovan
,
Sara A Paciga
,
Nancy L Pedersen
,
Brenda W J H Penninx
,
Roy H Perlis
,
David J Porteous
,
James B Potash
,
Martin Preisig
,
Marcella Rietschel
,
Catherine Schaefer
,
Thomas G Schulze
,
Jordan W Smoller
,
Kari Stefansson
,
Henning Tiemeier
,
Rudolf Uher
,
Henry Völzke
,
Myrna M Weissman
,
Thomas Werge
,
Cathryn M Lewis
,
Douglas F Levinson
,
Gerome Breen
,
Anders D Børglum
,
Patrick F Sullivan
Kylie P Glanville
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361591
- ORCID : 0000-0001-8321-9435
Jonathan R I Coleman
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1274890
- ORCID : 0000-0002-6759-0944
Ken B Hanscombe
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361592
- ORCID : 0000-0002-3715-6805
Jack Euesden
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361593
- ORCID : 0000-0002-6790-1925
Shing Wan Choi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361594
- ORCID : 0000-0003-2215-3238
Kirstin L Purves
- Fonction : Auteur
Gerome Breen
- Fonction : Auteur
Tracy M Air
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361595
- ORCID : 0000-0002-4834-4238
Till F M Andlauer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 826494
- ORCID : 0000-0002-2917-5889
Bernhard T Baune
- Fonction : Auteur
Elisabeth B Binder
- Fonction : Auteur
Douglas H R Blackwood
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361596
- ORCID : 0000-0002-4076-9346
Dorret I Boomsma
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1183479
- ORCID : 0000-0002-7099-7972
Henriette N Buttenschøn
- Fonction : Auteur
Lucía Colodro-Conde
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361597
- ORCID : 0000-0002-9004-364X
Udo Dannlowski
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1356025
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Nese Direk
- Fonction : Auteur
Erin C Dunn
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361598
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Andreas J Forstner
- Fonction : Auteur
Eco J C de Geus
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1275055
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Hans J Grabe
- Fonction : Auteur
Steven P Hamilton
- Fonction : Auteur
Ian Jones
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361599
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Lisa A Jones
- Fonction : Auteur
James A Knowles
- Fonction : Auteur
Zoltán Kutalik
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1275013
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Douglas F Levinson
- Fonction : Auteur
Glyn Lewis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361600
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Penelope A Lind
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1298211
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Susanne Lucae
- Fonction : Auteur
Patrik K Magnusson
- Fonction : Auteur
Peter Mcguffin
- Fonction : Auteur
Andrew M Mcintosh
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1178325
- ORCID : 0000-0002-0198-4588
Yuri Milaneschi
- Fonction : Auteur
Ole Mors
- Fonction : Auteur
Sara Mostafavi
- Fonction : Auteur
Bertram Müller-Myhsok
- Fonction : Auteur
Nancy L Pedersen
- Fonction : Auteur
Brenda W J H Penninx
- Fonction : Auteur
James B Potash
- Fonction : Auteur
Martin Preisig
- Fonction : Auteur
Stephan Ripke
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361601
- ORCID : 0000-0003-3622-835X
Jianxin Shi
- Fonction : Auteur
Stanley I Shyn
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361602
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Jordan W Smoller
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361603
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Fabian Streit
- Fonction : Auteur
- PersonId : 792531
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Patrick F Sullivan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763175
- ORCID : 0000-0002-6619-873X
Henning Tiemeier
- Fonction : Auteur
Rudolf Uher
- Fonction : Auteur
Sandra van der Auwera
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1361604
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Myrna M Weissman
- Fonction : Auteur
Paul F O'Reilly
- Fonction : Auteur
Cathryn M Lewis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1215664
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Naomi R Wray
- Fonction : Auteur
Stephan Ripke
- Fonction : Auteur
Manuel Mattheisen
- Fonction : Auteur
Maciej Trzaskowski
- Fonction : Auteur
Enda M Byrne
- Fonction : Auteur
Abdel Abdellaoui
- Fonction : Auteur
Mark J Adams
- Fonction : Auteur
Esben Agerbo
- Fonction : Auteur
Tracy M Air
- Fonction : Auteur
Till F M Andlauer
- Fonction : Auteur
Silviu-Alin Bacanu
- Fonction : Auteur
Marie Bækvad-Hansen
- Fonction : Auteur
Aartjan T F Beekman
- Fonction : Auteur
Tim B Bigdeli
- Fonction : Auteur
Elisabeth B Binder
- Fonction : Auteur
Julien Bryois
- Fonction : Auteur
Henriette N Buttenschøn
- Fonction : Auteur
Jonas Bybjerg-Grauholm
- Fonction : Auteur
Na Cai
- Fonction : Auteur
Enrique Castelao
- Fonction : Auteur
Jane Hvarregaard Christensen
- Fonction : Auteur
Toni-Kim Clarke
- Fonction : Auteur
Jonathan R I Coleman
- Fonction : Auteur
Lucía Colodro-Conde
- Fonction : Auteur
Nick Craddock
- Fonction : Auteur
Gregory E Crawford
- Fonction : Auteur
Gail Davies
- Fonction : Auteur
Ian J Deary
- Fonction : Auteur
Franziska Degenhardt
- Fonction : Auteur
Eske M Derks
- Fonction : Auteur
Nese Direk
- Fonction : Auteur
Conor V Dolan
- Fonction : Auteur
Erin C Dunn
- Fonction : Auteur
Thalia C Eley
- Fonction : Auteur
Valentina Escott-Price
- Fonction : Auteur
Farnush Farhadi Hassan Kiadeh
- Fonction : Auteur
Hilary K Finucane
- Fonction : Auteur
Jerome C Foo
- Fonction : Auteur
Andreas J Forstner
- Fonction : Auteur
Josef Frank
- Fonction : Auteur
Héléna A Gaspar
- Fonction : Auteur
Michael Gill
- Fonction : Auteur
Fernando S Goes
- Fonction : Auteur
Scott D Gordon
- Fonction : Auteur
Jakob Grove
- Fonction : Auteur
Lynsey S Hall
- Fonction : Auteur
Christine Søholm Hansen
- Fonction : Auteur
Thomas F Hansen
- Fonction : Auteur
Stefan Herms
- Fonction : Auteur
Ian B Hickie
- Fonction : Auteur
Per Hoffmann
- Fonction : Auteur
Georg Homuth
- Fonction : Auteur
Carsten Horn
- Fonction : Auteur
Jouke-Jan Hottenga
- Fonction : Auteur
David M Hougaard
- Fonction : Auteur
David M Howard
- Fonction : Auteur
Marcus Ising
- Fonction : Auteur
Rick Jansen
- Fonction : Auteur
Ian Jones
- Fonction : Auteur
Lisa A Jones
- Fonction : Auteur
Eric Jorgenson
- Fonction : Auteur
James A Knowles
- Fonction : Auteur
Isaac S Kohane
- Fonction : Auteur
Julia Kraft
- Fonction : Auteur
Warren W Kretzschmar
- Fonction : Auteur
Zoltán Kutalik
- Fonction : Auteur
Yihan Li
- Fonction : Auteur
Penelope A Lind
- Fonction : Auteur
Donald J Macintyre
- Fonction : Auteur
Dean F Mackinnon
- Fonction : Auteur
Robert M Maier
- Fonction : Auteur
Wolfgang Maier
- Fonction : Auteur
Jonathan Marchini
- Fonction : Auteur
Hamdi Mbarek
- Fonction : Auteur
Patrick Mcgrath
- Fonction : Auteur
Peter Mcguffin
- Fonction : Auteur
Sarah E Medland
- Fonction : Auteur
Divya Mehta
- Fonction : Auteur
Christel M Middeldorp
- Fonction : Auteur
Evelin Mihailov
- Fonction : Auteur
Yuri Milaneschi
- Fonction : Auteur
Lili Milani
- Fonction : Auteur
Francis M Mondimore
- Fonction : Auteur
Grant W Montgomery
- Fonction : Auteur
Sara Mostafavi
- Fonction : Auteur
Niamh Mullins
- Fonction : Auteur
Matthias Nauck
- Fonction : Auteur
Bernard Ng
- Fonction : Auteur
Michel G Nivard
- Fonction : Auteur
Dale R Nyholt
- Fonction : Auteur
Paul F O'Reilly
- Fonction : Auteur
Hogni Oskarsson
- Fonction : Auteur
Michael J Owen
- Fonction : Auteur
Jodie N Painter
- Fonction : Auteur
Carsten Bøcker Pedersen
- Fonction : Auteur
Marianne Giørtz Pedersen
- Fonction : Auteur
Roseann E Peterson
- Fonction : Auteur
Erik Pettersson
- Fonction : Auteur
Wouter J Peyrot
- Fonction : Auteur
Giorgio Pistis
- Fonction : Auteur
Danielle Posthuma
- Fonction : Auteur
Jorge A Quiroz
- Fonction : Auteur
Per Qvist
- Fonction : Auteur
John P Rice
- Fonction : Auteur
Brien P Riley
- Fonction : Auteur
Margarita Rivera
- Fonction : Auteur
Saira Saeed Mirza
- Fonction : Auteur
Robert Schoevers
- Fonction : Auteur
Eva C Schulte
- Fonction : Auteur
Ling Shen
- Fonction : Auteur
Jianxin Shi
- Fonction : Auteur
Stanley I Shyn
- Fonction : Auteur
Engilbert Sigurdsson
- Fonction : Auteur
Grant C B Sinnamon
- Fonction : Auteur
Johannes H Smit
- Fonction : Auteur
Daniel J Smith
- Fonction : Auteur
Hreinn Stefansson
- Fonction : Auteur
Stacy Steinberg
- Fonction : Auteur
Fabian Streit
- Fonction : Auteur
Jana Strohmaier
- Fonction : Auteur
Katherine E Tansey
- Fonction : Auteur
Henning Teismann
- Fonction : Auteur
Alexander Teumer
- Fonction : Auteur
Wesley Thompson
- Fonction : Auteur
Pippa A Thomson
- Fonction : Auteur
Thorgeir E Thorgeirsson
- Fonction : Auteur
Matthew Traylor
- Fonction : Auteur
Jens Treutlein
- Fonction : Auteur
Vassily Trubetskoy
- Fonction : Auteur
Andrés G Uitterlinden
- Fonction : Auteur
Daniel Umbricht
- Fonction : Auteur
Sandra van der Auwera
- Fonction : Auteur
Albert M van Hemert
- Fonction : Auteur
Alexander Viktorin
- Fonction : Auteur
Peter M Visscher
- Fonction : Auteur
Yunpeng Wang
- Fonction : Auteur
Bradley T Webb
- Fonction : Auteur
Shantel Marie Weinsheimer
- Fonction : Auteur
Jürgen Wellmann
- Fonction : Auteur
Gonneke Willemsen
- Fonction : Auteur
Stephanie H Witt
- Fonction : Auteur
Yang Wu
- Fonction : Auteur
Hualin S Xi
- Fonction : Auteur
Jian Yang
- Fonction : Auteur
Futao Zhang
- Fonction : Auteur
Volker Arolt
- Fonction : Auteur
Bernhard T Baune
- Fonction : Auteur
Klaus Berger
- Fonction : Auteur
Dorret I Boomsma
- Fonction : Auteur
Sven Cichon
- Fonction : Auteur
Udo Dannlowski
- Fonction : Auteur
Ejc de Geus
- Fonction : Auteur
J Raymond Depaulo
- Fonction : Auteur
Enrico Domenici
- Fonction : Auteur
Katharina Domschke
- Fonction : Auteur
Tõnu Esko
- Fonction : Auteur
Hans J Grabe
- Fonction : Auteur
Steven P Hamilton
- Fonction : Auteur
Caroline Hayward
- Fonction : Auteur
Andrew C Heath
- Fonction : Auteur
Kenneth S Kendler
- Fonction : Auteur
Stefan Kloiber
- Fonction : Auteur
Glyn Lewis
- Fonction : Auteur
Qingqin S Li
- Fonction : Auteur
Susanne Lucae
- Fonction : Auteur
Pamela Af Madden
- Fonction : Auteur
Patrik K Magnusson
- Fonction : Auteur
Nicholas G Martin
- Fonction : Auteur
Andrew M Mcintosh
- Fonction : Auteur
Andres Metspalu
- Fonction : Auteur
Ole Mors
- Fonction : Auteur
Preben Bo Mortensen
- Fonction : Auteur
Bertram Müller-Myhsok
- Fonction : Auteur
Merete Nordentoft
- Fonction : Auteur
Markus M Nöthen
- Fonction : Auteur
Michael C O'Donovan
- Fonction : Auteur
Sara A Paciga
- Fonction : Auteur
Nancy L Pedersen
- Fonction : Auteur
Brenda W J H Penninx
- Fonction : Auteur
Roy H Perlis
- Fonction : Auteur
David J Porteous
- Fonction : Auteur
James B Potash
- Fonction : Auteur
Martin Preisig
- Fonction : Auteur
Marcella Rietschel
- Fonction : Auteur
Catherine Schaefer
- Fonction : Auteur
Thomas G Schulze
- Fonction : Auteur
Jordan W Smoller
- Fonction : Auteur
Kari Stefansson
- Fonction : Auteur
Henning Tiemeier
- Fonction : Auteur
Rudolf Uher
- Fonction : Auteur
Henry Völzke
- Fonction : Auteur
Myrna M Weissman
- Fonction : Auteur
Thomas Werge
- Fonction : Auteur
Cathryn M Lewis
- Fonction : Auteur
Douglas F Levinson
- Fonction : Auteur
Gerome Breen
- Fonction : Auteur
Anders D Børglum
- Fonction : Auteur
Patrick F Sullivan
- Fonction : Auteur
Résumé
BACKGROUND: The prevalence of depression is higher in individuals with autoimmune diseases, but the mecha- nisms underlying the observed comorbidities are unknown. Shared genetic etiology is a plausible explanation for the overlap, and in this study we tested whether genetic variation in the major histocompatibility complex (MHC), which is associated with risk for autoimmune diseases, is also associated with risk for depression. METHODS: We fine-mapped the classical MHC (chr6: 29.6–33.1 Mb), imputing 216 human leukocyte antigen (HLA) alleles and 4 complement component 4 (C4) haplotypes in studies from the Psychiatric Genomics Consortium Major Depressive Disorder Working Group and the UK Biobank. The total sample size was 45,149 depression cases and 86,698 controls. We tested for association between depression status and imputed MHC variants, applying both a region-wide significance threshold (3.9 3 1026 ) and a candidate threshold (1.6 3 1024 ). RESULTS: No HLA alleles or C4 haplotypes were associated with depression at the region-wide threshold. HLA- B*08:01 was associated with modest protection for depression at the candidate threshold for testing in HLA genes in the meta-analysis (odds ratio = 0.98, 95% confidence interval = 0.97–0.99). CONCLUSIONS: We found no evidence that an increased risk for depression was conferred by HLA alleles, which play a major role in the genetic susceptibility to autoimmune diseases, or C4 haplotypes, which are strongly asso- ciated with schizophrenia. These results suggest that any HLA or C4 variants associated with depression either are rare or have very modest effect sizes.
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